Matériel complémentaire pour l’UE Introduction à la bioinformatique (SSV3U15, L2 SV AMU)

Ce site contient le matériel complémentaire pour le cours Introduction à la bioinformatique, dispensé 2ème licence en Sciences de la vie (L2 SV), Aix-Marseille Université (AMU).

Le site principal se trouve sur la plateforme Ametice d’Aix-Marseille Université, en accès réservé aux étudiants inscrits.

Sites de support de cours

Site	Contenu	Lien
Ametice	Gestion de l’UE, QCM, forum, …	https://ametice.univ-amu.fr/course/view.php?id=125268
Pages Web	énoncés et données des TP	https://jvanheld.github.io/intro-bioinfo-L2-SV-AMU-SSV3U15_public/

Cours

Note: le cours comporte 7 séance de CM. Les vidéos sont découpées par chapitres thématiques plutôt que par séances de CM.

Chap	Titre	Vidéo	Diapo
0	Organisation du cours et modalités de contrôle des connaissances	SSV3U15-00
1	Présentation du cours	SSV3U15-01	pdf
2	Séquence - structure - fonction	SSV3U15-02	pdf
3	Du gène au génome	en cours de montage	pdf
4	Inférence phylogénétique : retracer l’évolution à partir des séquences	SSVU315-04
5	Génomique personnalisée	à venir
6	Exploration de la biodiversité	à venir
7	Réseaux et systèmes biologiques	à venir
8	L’information au cœur du vivant	à venir

Travaux pratiques

TP	Titre et lien	Enoncés	Diapo
1	Séquence - structure - fonction	tuto/exo TP1
2	Du gène à la protéine	tuto/exo TP2	diapo TP2
3	Du gène au génome et au protéome	tuto/exo TP3	tuto illustré TP3 Nouvelle formule !
4	Alignements par paires et alignements multiples
5	Inférence phylogénétique
6	Variants génétiques
7	Systèmes et réseaux biologiques
8	Récapitulation, questions/réponses

Autres supports de cours

Titre	Description	Lien
Glossaire	Explication des termes de bioinformatique et concepts biologiques sous-jacents au cours	html
Structures 3D	Figures et animations de structures tridimensionnelles de macromolécules	structures