intro-bioinfo-L2-SV-AMU-SSV3U15_public
Cours d'introduction à la bioinformatique, 2ème licence en Sciences de la vie, Aix-Marseille Université (L2 SV AMU)
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Matériel complémentaire pour l’UE Introduction à la bioinformatique (SSV3U15, L2 SV AMU)
Ce site contient le matériel complémentaire pour le cours Introduction à la bioinformatique, dispensé 2ème licence en Sciences de la vie (L2 SV), Aix-Marseille Université (AMU).
Le site principal se trouve sur la plateforme Ametice d’Aix-Marseille Université, en accès réservé aux étudiants inscrits.
Sites de support de cours
| Site | Contenu | Lien |
|---|---|---|
| Ametice | Gestion de l’UE, QCM, forum, … | https://ametice.univ-amu.fr/course/section.php?id=1521633 |
| Pages Web | énoncés et données des TP | https://jvanheld.github.io/intro-bioinfo-L2-SV-AMU-SSV3U15_public/ |
Cours
Note: le cours comporte 7 séance de CM. Les vidéos sont découpées par chapitres thématiques plutôt que par séances de CM.
| Chap | Titre | Vidéo | Diapo détaillées | Diapo allégées |
|---|---|---|---|---|
| 0 | Organisation du cours et modalités de contrôle des connaissances | diapo 00 | ||
| 1 | Présentation du cours | diapo 01 | ||
| 2 | Séquence - structure - fonction | diapo 02 | ||
| 3 | Du gène au génome | diapo 03 | ||
| 4 | Inférence phylogénétique : retracer l’évolution à partir des séquences | 04 détaillée | 04 allégée | |
| 5 | Du génome aux génomes : génomique des populations | 05 détaillée | 05 allégée | |
| 6 | Médecine génomique personnalisée | 06 détaillée | 06 allégée | |
| 7 | Réseaux et systèmes biologiques | diapo 07 |
Travaux pratiques
| TP | Titre et lien | Enoncés | Diapo |
|---|---|---|---|
| 1 | Séquence - structure - fonction | tuto/exo TP1 | tuto illustré TP1 |
| 2 | Du gène à la protéine | tuto/exo TP2 | diapo TP2 |
| 3 | Du gène au génome et au protéome | tuto/exo TP3 | tuto illustré TP3 |
| 4 | Alignements par paires et alignements multiples | tuto illustré TP4 | |
| 5 | Inférence phylogénétique | tuto illustré TP5 | |
| 6 | Variations génétiques | tuto illustré TP6 | |
| 7 | Systèmes et réseaux biologiques | tuto illustré TP7 | |
| 8 | Récapitulation, questions/réponses | tuto illustré TP8 |
Autres supports de cours
| Titre | Description | Lien |
|---|---|---|
| Préparation à l’examen | Document de préparation à l’examen : matériel à apporter, informations sur les types de questions, pondération, … | |
| Glossaire | Explication des termes de bioinformatique et concepts biologiques sous-jacents au cours | html |
| Structures 3D | Figures et animations de structures tridimensionnelles de macromolécules | structures |
Licence
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Archives
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